Un test de hipótesis sobre ancestría
Dia | 2019-10-15 14:00:00-03:00 |
Hora | 2019-10-15 14:00:00-03:00 |
Lugar | Instituto de Estadística (Eduardo Acevedo 1139) |
Un test de hipótesis sobre ancestría
Gabriel Illanes (CMAT-FCIEN-UdelaR)
Desde la completación del proyecto "Human Genome Project" en 2003, se ha utilizado la información genética de los individuos para resonder distintas preguntas. Una base de datos muy usada es la del "1000 genomes project"; uno de los usos es es el estudio de las migraciones de distintas poblaciones ancestrales. En nuestro caso, contamos con la base de datos del proyecto "Urugenomes", disponiendo de la información genética de 20 individuos uruguayos; 10 de ellos declaran tener algún ancestro nativo americano, 10 de ellos declaran tener algún ancestro africano. Dado el tamaño de la base de datos, nos enfocamos en intentar responder preguntas a nivel individual, y no a nivel poblacional. Para cada uno de estos individuos, asumimos que es una mezcla de tres poblaciones ancestrales (europeos, africanos, y nativos americanos), y utilizamos algoritmos que permiten la identificación de los intervalos de su genoma que corresponden a cada una de esas poblaciones ancestrales. Con esta información, queremos desarrollar un test de hipótesis que permita saber si es posible que un individuo dado tenga un ancestro nativo americano puro "T" generaciones atrás.
Recuerden que todas las presentaciones y el programa tentativo de las próximas charlas está disponible en https://github.com/natydasilva/SIESTA